Nei dintorni di Milano vi sono tre aeroporti dedicati al normale traffico civile: Malpensa, Linate e Orio al Serio. Complessivamente l'aeroporto milanese, quello varesino e quello bergamasco gestiscono ogni anno un traffico di circa 30 milioni di passeggeri e di circa 600 mila tonnellate di merci gestite. Rappresentano il sistema aeroportuale più importante d'Italia nell'Area Metropolitana milanese si concentra la maggior parte del traffico aereo italiano. Il maggiore è l'Aeroporto "Città di Milano" di Milano-Malpensa, situato in provincia di Varese, al confine col Piemonte, ed immerso nel Parco del Ticino. Dista 45 Km da Milano (centro). È collegato direttamente al centro città tramite la navetta ferroviaria Malpensa Express (34-40 minuti di tragitto), che parte dalla stazione di Milano Cadorna, e con diverse linee di bus. Il più vicino è l'Aeroporto "Enrico Forlanini" di Linate, che ospita esclusivamente il traffico nazionale, europeo e low-cost. Si trova nella zona est della città, alla quale è collegato dalle linee ATM 73 e X73 (da Piazza San Babila). L'aeroporto "Antonio Locatelli", Aeroporto di Milano-Orio al Serio, situato in provincia di Bergamo, quarto in Italia per numero di passeggeri a partire dagli ultimi mesi del 2009, si trova nel comune di Orio al Serio, (BG), a 5 km di distanza da Bergamo e 45 da Milano (centro). È il terzo scalo aereo per affluenza all'interno del sistema aeroportuale milanese-lombardo e la capitale italiana dei voli low cost.